酶活性

土壤酶活性的测量

土壤酶活性经常提出作为土壤质量的敏感指标。如Schloter等人的强调。（2003年），理想的土壤微生物和生物化学指导者矿石矿石质量质量可能要测量，如果在所有环境中都能良好，并可靠地揭示存在哪些问题。作者认为酶促测定非常有用，因为它们是短期实验室程序，通常在标准化的环境下进行...

从土壤中提取酶

1954年，在土壤提取物中测量了类似组织蛋白酶样活性（Antoniani等，1954）。但是，根据Skujins（1967）的说法，费米和萨布拉玛 - 尼安是第一个测量的人酶活性（分别在土壤提取物中）。从Briggs and Segal（1963）从pH 6的表面森林土壤中分离出尿素酶，并在美国纯化。在澳大利亚，Ladd（1972）确定了几种牧场和...

细胞破裂取决于细胞类型和生长

由于后者的肽聚糖层较厚，因此与革兰氏阳性细菌相比，与革兰氏阳性细菌相比，破裂细胞的物理手段通常更有效。肽聚糖层的强度不仅取决于其厚度，还取决于肽交联的程度（Pisabaro等人，1985年）。交联的数量在物种之间可能有所不同，但是对于每个物种，它也取决于生长速率。增长将一定意味着必须削弱墙壁，以使其成为...

珠子跳动效率和偏见

珠子跳动一直是细胞裂解方案的流行组成部分。土壤浆液（或提取细胞的悬浮液）与小球（最常见的是0.1或0.2 mm球，有时与较大的珠子混合），并以高频摇动。珠子跳动会利用玻璃球之间的碰撞破坏细胞，因此变形可能是细胞破坏的主要原因，尽管粘性剪切在高速下可能很重要。公认的批判性物理...

影响土壤酶活性的因素

由于土壤环境的复杂性，似乎有几个因素会影响酶活性在土壤中。正如Gianfreda和Bollag（1996）以及Dick and Tabatabai（1999）所讨论的，土壤中任何酶的活性是酶合成，持久性，稳定，调节和催化行为的结果蛋白质在测定时刻存在于土壤环境中（图12.1）。所有这些过程可能会动态相互关联和影响...

酶活性与土壤物理特性与土壤深度之间的关系

土壤酶活性通常与土壤微生物种群的大小有关，并且受30-200 m的毛孔量的积极影响（Pagliai和de Nobili 1993）。Marinari等。（2000年）表明，有机肥料的添加改善了土壤的物理和微生物学特性。他们报道了酸性磷酸酶和脱氢酶活性与土壤总孔隙率之间的线性相关性显着，而苯并甲酰胺酰胺水解活性不是...

分析方法

关于土壤中存在或不存在特定多肽的推论的可靠性蛋白质提取物不仅取决于提取程序的严格性，还取决于用于估计提取物中蛋白质分子浓度的技术的准确性，以及用于蛋白质检测的分析技术的灵敏度。出于大多数目的，可以通过分光光度法分析来确定给定提取物中的蛋白质浓度...

土壤聚合物和C1化合物的生物降解

在土壤中发现的最自然来源的最普遍的聚合物是纤维素和几丁质。纤维素分解活性对于碳很重要回收并且几丁质是土壤中最丰富的氮来源的独特作用。在土壤微生物（以及许多较高的生物体）中，几丁碱水解能力无处不在，而几丁质是大多数环境中N的重要来源。许多细菌具有多种几丁质酶基因，真菌几丁质酶可能在营养和菌丝细胞中具有双重作用。

在土壤中引入DNA的降解动力学

使用两种不同的方法将纯化的DNA引入土壤中，并引入了包含要追踪的DNA的细胞或组织材料。通过DOT印迹和南部杂交和CACL2处理的大肠杆菌（Romanowski etal。1992）以及通过定量的PCR和电​​载型和电载体，在不同的非菌群土壤中可检测到重组质粒DNA多达60天（实验结束），并通过定量PCR和电​​载质和电载质。大肠杆菌（Romanowski等，1993b）。例如，在壤土的土壤中...

rRNA方法

核糖体RNA基因，尤其是小型亚基SSU核糖体RNA基因，已成为参与土壤传播微生物群落原位表征的微生物生态学家的首选靶标。该标记物的许多特性使其在此类研究中非常有用1它在所有已知生物中的普遍存在，并且其在生物体之间缺乏水平基因转移Sneath 1993 2保守的二级结构，促进了序列序列对准van de peer等。..

酶裂解

酶通常用于单独或与化学物质和物理手段结合裂解细胞，或者简单地使细胞渗透到完整的细胞囊中允许材料输入和流出完整的细胞囊（对于显微镜分析，例如荧光，例如原位杂交，是鱼类的杂交，）。通常，酶是选择性的，下面的详细评论将显示。溶菌酶是迄今为止最常用的酶，通过将0-1-4糖苷键在...中溶解细菌细胞壁。

检测抗生素和重金属抗性基因

在土壤等环境中，重点是原位检测抗生素或重金属耐药基因的研究相对较少。大多数研究都集中在临床和环境分离株中耐药基因的检测上。使用常规DNA提取和PCR方法在土壤中检测到了抗性基因。Chee-Sanford等。2001年在与猪生产设施相关的地下水中筛选了八个TET基因。发现四环素抗性基因...

土壤蛋白质组学

现在已经认识到，在土壤微生物学中，还需要超越DNA分析，以更好地了解土壤功能（Nan-Nipieri等，2003）。通过表征DNA和RNA，一个人可能能够确定在测量过程中有效涉及的实际物种。最近发表了涉及从土壤中同时提取RNA和DNA的不同方案（Duarte等，1998 Griffiths等人2000 Hurt等，2001 Weinbauer等人...

测定土壤功能DNA持久性的方法

检测土壤中特定DNA片段的最敏感方法是通过PCR扩增它们。放大的序列主要仅是基因的一部分，通常降低到约100个核苷酸的大小（Recorbet等，1993），该核苷酸是不知道监测是遵循大型DNA分子还是较小降解产物的持续性。最近，已经提出了许多生物监测技术，这些技术可以通过自然遗传来量化数量的DNA分子...